DESCRIPTION :
Mission Au sein du plateau de microbiologie, localisé dans l'équipe MII, l'ingénieur.e d'études aura pour
principale mission générale de renforcer et développer les projets "transdisciplinaires" intégrant une
approche relative au microbiote intestinal et d'autres disciplines.
A cet effet, les missions plus spécifiques de l'ingénieur.e d'études seront de :
(i) cultiver des microbiotes (intestinaux ou pulmonaires, murins ou humains, issus de
prélèvements de sujets sains ou de patients atteints de pathologies humaines) en aérobie,
stations anaérobie, fermenteurs ou système d'intestin artificiel (SHIME ® ).
(ii) isoler des souches microbiennes à partir de ces microbiotes et participer à la gestion de la
biocollection
(iii) participer à l'analyse de la composition et de la fonction de ces microbiotes (extraction d'ADN
et métabolomique) et aux tests microbiologiques de surveillance des souris axéniques.
(iv) assurer la maintenance des équipements, en particulier de l'intestin artificiel.
(v) favoriser les collaborations entre l'équipe MII et les autres équipes du centre, mais également
les équipes hors centre (collaborations académiques et industrielles nationales et
internationales), pour l'étude de la composition et des fonctions des microbiotes grâce aux
équipements disponibles sur le plateau de microbiologie.
Activités * concevoir, conduire et optimiser des expériences de microbiologie : préparation de milieux,
principales ensemencement, isolement de micro-organismes (bactéries, phages, champignons),
congélation de micro-organismes, culture de micro-organismes en conditions aérobie ou
anaérobie, en tubes, en microplaques, en fermenteurs ou en SHIME® ;
* participer à la logistique concernant l'acheminement et le stockage des échantillons ;
* réaliser l'ensemble du processus d'analyse de composition des microbiotes : extraction
d'ADN (fécal, pulmonaire, luminal, mucosal...), validation de la qualité de l'ADN extrait,
analyse de la composition par PCR quantitative (PCR elle-même et analyse des résultats),
préparation des échantillons d'ADN pour envoi au séquençage ;
Institut national de la santé et de la recherche médicale 2, * préparation, stockage et envoi des échantillons pour l'analyse de la fonction des
microbiotes par métabolomique ciblée (dosage de métabolites)
* test des fonctions du microbiote sur cellules en culture in vitro (stimulation de lignées
cellulaires, ou cellules primaires isolées de sang ou de biopsies de sujets sains ou de
patients puis dosage de cytokines)
* réalisation des tests microbiologiques de surveillance des souris axéniques (tests sur
gélose et PCR) (avec la possibilité pour l'ingénieur.e de s'impliquer pleinement au cours du
temps dans les projets d'axénie au-delà des controles microbiologiques)
* choisir et adapter les technologies d'analyse et d'expérimentation en fonction des objectifs
de recherche ;
* rédiger des procédures d'utilisation des équipements ;
* formaliser et actualiser l'ensemble des protocoles techniques utilisés ;
* assurer l'entretien et la maintenance des équipements ;
* former les nouveaux entrants
* conseiller, avec l'aide de la responsable scientifique du plateau des porteurs de projets
d'autres équipes sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d'analyse, leur
interprétation, et en assurer le suivi ;
* assurer la gestion des stocks en lien avec l'activité ;
* assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité ;
* assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité ;
* rassembler et mettre en forme les résultats des expériences en utilisant les outils de
bureautique classiques (Excel, GraphPad, Powerpoint) et les presenter;
* communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs des différentes équipes.
Spécificité(s) et * L'ingénieur.e d'Etudes sera localisée au sein de l'équipe MII sur le bâtiment facultaire (27,
environnement rue Chaligny, 75012 Paris) et bénéficiera de l'environnement humain et technologique de
du poste l'équipe et du CRSA. Il.elle travaillera sur des échantillons humains et particulièrement sur
des échantillons de microbiote fécal qu'il/elle devra manipuler de manière quotidienne.
Connaissances * Microbiologie appliquée et de l'environnement
* Biologie moléculaire
* Physiologie (notamment intestinale)
Savoir-faire Savoir-faire techniques :
* mettre en oeuvre des techniques de microbiologie et plus particulièrement de culture
microbienne.
* mettre en oeuvre des techniques de biologie moléculaire de base (extraction ADN, PCR...)
* organiser et gérer des échantillons ou des collections de souches microbiennes
Autres savoir-faire :
* organiser et gérer différents projets en parallèle
* analyser et présenter ses résultats
* communiquer et gérer des relations avec les interlocuteurs internes, les interlocuteurs
externes et les différents corps de métiers (techniciens, ingénieurs, chercheurs, médecins et
enseignant-chercheurs)
* être disponible et organisé pour assurer la maintenance des équipements
* comprendre et s'exprimer en anglais scientifique
Aptitudes * Savoir travailler en équipe, se mettre au service d'autres équipes et interagir avec plusieurs
corps de métiers
* Communiquer, être rigoureux et impliqué
* Partager ses idées avec ses interlocuteurs
Code d'emploi : Ingénieur Support (h/f)
Domaine professionnel actuel : Employés Support Informatique et Bureautique
Niveau de formation : Bac+5
Temps partiel / Temps plein : Plein temps
Type de contrat : Contrat à durée déterminée (CDD)
Compétences : Microsoft Excel, Automatisation du Bureau, Microsoft PowerPoint, Autodiscipline, Esprit d'Équipe, Physiologie, Biologie Molleculaire, Recherche Médicale, Bioréacteurs, Extraction d'ADN, Gestion des Procédures Standard, Application des Normes d'Hygiène, Maintenance et Dépannage, Métabolomique, Microbiologie, Inventaire et Contrôle du Stock, Suivi des Résultats, Transformation Moléculaire, Nettoyage des Batiments et Locaux
Courriel :
emploi.handicap@inserm.fr
nathalie.rolhion@inserm.fr
Type d'annonceur : Employeur direct