DESCRIPTION :
Mission L'ingénieur.e de recherche contribuera au développement et à la mise en œuvre d'analyses bioprincipale
informatiques avancées appliquées à la transcriptomique en cellule unique et à la
transcriptomique spatiale.
La personne recrutée aura pour mission de concevoir, adapter et déployer des outils
permettant d'explorer l'hétérogénéité et les interactions cellulaires dans le microenvironnement
tumoral humain, avec un accent particulier sur les populations myéloïdes (monocytes,
macrophages, cellules dendritiques).
Activités * Identifier, adapter et utiliser des outils et pipelines existants pour l'analyse de données de
principales transcriptomique en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale
(technologies de type MERSCOPE, Visium, etc.)
* Développer de nouveaux scripts ou modules bioinformatiques pour l'intégration et la
visualisation de données multi-omiques
* Participer à la conception et à la mise en œuvre de stratégies analytiques en collaboration
avec les biologistes du laboratoire
* Contribuer à l'annotation, la comparaison et l'interprétation biologique des populations
cellulaires identifiées
* Documenter et assurer la reproductibilité des analyses (versioning, documentation, pipeline
management)
* Participer à la valorisation des résultats (figures, rapports, contribution à la rédaction
d'articles scientifiques)
* Interagir avec les autres bioinformaticiens et ingénieurs de l'Institut Mondor de Recherche
Biomédicale (IMRB) pour partager outils et bonnes pratiques
Spécificité(s) et * Le poste est situé au sein de l'unité Inserm U955 (Institut Mondor de Recherche
environnement Biomédicale, Faculté de Santé de Créteil), dans une équipe spécialisée dans l'étude du
du poste microenvironnement immunitaire des tumeurs humaines
* Le travail s'inscrira dans une dynamique pluridisciplinaire associant immunologistes,
pathologistes, bioinformaticiens et cliniciens, autour de projets centrés sur la compréhension
du rôle des cellules myéloïdes dans la progression tumorale
* Le/la candidat.e bénéficiera d'un environnement scientifique riche, d'un accès à des
données de haute qualité (scRNA-seq, spatial transcriptomics, imagerie), et de l'appui du
réseau de bioinformatique de l'IMRB, Savoir-faire * Analyser, interpréter et intégrer des données issues de technologies scRNA-seq et spatiales
* Développer et documenter des pipelines reproductibles
* Gérer des jeux de données volumineux et complexes
* Communiquer efficacement les résultats à des biologistes non spécialistes
* Travailler en collaboration dans un environnement pluridisciplinaire
* Assurer une veille technologique sur les nouvelles approches analytiques
Aptitudes * Curiosité scientifique et intérêt marqué pour la biologie et l'immunologie
Institut national de la santé et de la recherche médicale 2
Code d'emploi : Biologiste d'Analyse (h/f)
Domaine professionnel actuel : Biologistes
Niveau de formation : Bac
Temps partiel / Temps plein : Plein temps
Type de contrat : Contrat à durée déterminée (CDD)
Compétences : Analyse des Données, Intégration de Données, Visualisation de Données, Linux, Python (Langage de Programmation), Logiciel Versioning, Git, Gestion des Données, Docker, Adaptabilité, Sens de la Communication, Sens de l'Organisation, Minutie ou Attention aux Détails, Esprit d'Équipe, Motivation Personnelle, Curiosité, Génie Biomédical, Biologie, Recherche Médicale, Immunologie, Veille Concurrentielle, Création de Contenu, Écologie, Biologie Moléculaire et Cellulaire, Oncologie, Néoplasie, Etudes et Statistiques, Imagerie, Montage et Démontage
Courriel :
charles-antoine.dutertre@u-pec.fr
emploi.handicap@inserm.fr
Type d'annonceur : Employeur direct